Kaip mokslininkai naudoja mikrogardelių analizę?

Mikrogardelių analizė apima ląstelės sulaužymą, jos genetinio turinio išskyrimą, visų toje konkrečioje ląstelėje įjungtų genų identifikavimą ir tų genų sąrašo sudarymą. DNR mikrogardelių analizė yra metodas, kurį mokslininkai naudoja norėdami nustatyti, ar genai yra įjungti ar išjungti.

1. Kam naudojama mikrogardelių analizė?
2. Kodėl mokslininkai naudoja mikrogardelę?
3. Kaip šiandien naudojama mikrogardelių analizė?
4. Ką gali aptikti mikrogardelių analizė?
5. Kas yra mikromasyvas bioinformatikoje?
6. Koks yra egzonų gaudymo tikslas?
7. Kokios yra „microarray“ programos?
8. Kokia yra DNR mikrogardelių svarba?
9. Kaip mokslininkai nustato organizmo genetinę seką?
10. Kaip veikia mikrogardelė ir kaip ji naudojama?
11. Kuri iš šių technologijų naudojama mikrogardelių gamybai?
12. Kokie įrankiai naudojami mikrogardelių analizei?
13. Kas yra mikrogardelių technika?
14. Kiek tikslus yra mikrogardelių tyrimas?
15. Ką gali aptikti CMA?

Kam naudojama mikrogardelių analizė?

Mikrogardelė yra laboratorinė priemonė, naudojama tūkstančiams genų ekspresijai vienu metu aptikti. DNR mikrogardelės yra mikroskopo stikleliai, atspausdinti su tūkstančiais mažyčių dėmių nustatytose vietose, kurių kiekvienoje vietoje yra žinoma DNR seka arba genas.

Kodėl mokslininkai naudoja mikrogardelę?

Tiesą sakant, „microarray“ analizė leidžia tyrėjams pažvelgti į ekspresijos modelius visuose genuose visame genome – ir tai padaryti atliekant vieną procedūrą. Dėl to dabar galima vienu metu stebėti dešimčių tūkstančių genų veiklą.

Kaip šiandien naudojama mikrogardelių analizė?

Šiandien DNR mikrogardelės naudojamos kai kurių ligų klinikiniams diagnostiniams tyrimams. ... Mikrogardelės taip pat gali būti naudojamos tiriant, kiek tam tikri genai yra įjungti arba išjungti ląstelėse ir audiniuose. Šiuo atveju, užuot išskyrusi DNR iš mėginių, išskiriama ir išmatuojama RNR (kuri yra DNR nuorašas).

Ką gali aptikti mikrogardelių analizė?

Ką aptinka chromosomų mikrogardelė? Atliekant chromosomų mikrogardelių (CMA) testavimą, ieškoma papildomų (dubliuotų) arba trūkstamų (ištrintų) chromosomų segmentų, kartais vadinamų kopijų skaičiaus variantais (CNV).

Kas yra mikromasyvas bioinformatikoje?

„Mikromasyvas“ yra laboratorinis stiklelis, pagamintas iš stiklo, kurio paviršiuje nustatytose vietose yra tūkstančiai mažų porų. Jis veikia pagal komplementarių DNR grandžių hibridizacijos principą ir leidžia efektyviai analizuoti kelių genų ekspresijas vienoje reakcijoje.

Koks yra egzonų gaudymo tikslas?

Egzonų gaudymas yra molekulinės biologijos metodas, skirtas nustatyti galimus egzonus nežinomos introninės-egzoninės struktūros eukariotų DNR fragmente. Tai atliekama siekiant nustatyti, ar fragmentas yra išreikšto geno dalis.

Kokios yra „microarray“ programos?

Dabartinė mikro matricų taikymo sritis apima sekos nustatymą hibridizuojant, pakartotinę seką, mutacijų aptikimą, genų kopijų skaičiaus įvertinimą, lyginamąją genomo hibridizaciją, vaistų atradimą, ekspresijos analizę ir imuninį tyrimą (baltymų mikromatricas).

Kokia yra DNR mikrogardelių svarba?

DNR mikrogardelė yra veiksminga transkriptomikos priemonė, padedanti tirti ir analizuoti beveik kiekvieno organizme esančio geno mRNR ekspresiją. Kadangi yra prieinamas viso genomo mikroorganizmų sekos nustatymas, dabar tapo įmanoma nustatyti genus, turinčius potencialo bioremediacijai.

Kaip mokslininkai nustato organizmo genetinę seką?

Šios raidės ir spalvos žymi DNR kodą – chemines medžiagas, kurios sudaro mūsų genetinio plano grandinę. Mokslininkai gali paimti mėginius naudodami tamponą iš organizmų ir „skaityti“ jų DNR per procesą, vadinamą DNR sekos nustatymu.

Kaip veikia mikrogardelė ir kaip ji naudojama?

Mikro matricų principas yra tas, kad papildomos sekos jungsis viena su kita. Nežinomos DNR molekulės restrikcijos endonukleazės supjaustomos į fragmentus; prie šių DNR fragmentų yra prijungti fluorescenciniai žymenys. Tada jiems leidžiama reaguoti su DNR lusto zondais.

Kuri iš šių technologijų naudojama mikrogardelių gamybai?

Mikromatricos gali būti pagamintos naudojant įvairias technologijas, įskaitant spausdinimą smulkiais smeigtukais ant stiklelių, fotolitografiją naudojant iš anksto pagamintas kaukes, fotolitografiją naudojant dinaminius mikroveidrodinius įrenginius, rašalinį spausdinimą arba elektrochemiją ant mikroelektrodų matricų.

Kokie įrankiai naudojami mikrogardelių analizei?

Tik trys įrankiai gali apdoroti visų tipų klasikines mikromasyvas, būtent ArrayExpress ir NCBI GEO saugojimui ir Bioconductor analizei.

Kas yra mikrogardelių technika?

„Microarray“ technologija yra besivystanti technologija, naudojama daugelio genų ekspresijai vienu metu tirti. Tai apima tūkstančių genų sekų išdėstymą žinomose vietose ant stiklelio, vadinamo genų lustu. Mėginys, kuriame yra DNR arba RNR, dedamas į kontaktą su geno lustu.

Kiek tikslus yra mikrogardelių tyrimas?

CMA yra 100% tikslus nustatant įprastas prenatalinių mėginių aneuploidijas, palyginti su kariotipu (2, 16, 17), o NICHD tyrime jis parodė didesnį diagnostinį derlių, palyginti su standartiniu kariotipu 1.7% pacientų, nukreiptų atlikti pažengusią motinos, tėvų nerimo ir teigiamą serumo patikrą (2).

Ką gali aptikti CMA?

Prenatalinė CMA lygina tam tikrus negimusio kūdikio DNR regionus su normalaus genomo regionais. CMA gali aptikti chromosomų dubliacijas arba delecijas – vietas, kur yra papildomų arba trūkstamų DNR dalių, kurių neaptinka standartinis kariotipo tyrimas.